En la historia de Japón hubo época de violencia en la que se luchaba por cambiar el régimen del gobierno regente. Muchos de los que combatieron por esa causa, ahora son simples vagabundos tratando de adaptarse a este tiempo de paz. Rurouni Kenshin cuenta la historia de uno de los asesinos más despiadados del antiguo régimen Tokugawa, una de las tantas personas que ayudarán a traer una época de paz a Japón, sólo que ahora el asesino se ha vuelto un vagabundo y sólo usa su espada para proteger a sus seres queridos y así resarcirse por toda la sangre derramada en su pasado. El problema es que no muchos están dispuestos a dejarlo vivir.

El combate de Yahiko (primera parte) ; El combate de Yahiko (segunda parte) ; El combate de Yahiko (tercera parte) ; El kenjutsu en la era Meiji ; Raijuta ; La técnica secreta ; Encuentro en el jardín Tsukayama ; La fuerza de Yutaro , El enfrentamiento.